Realmente no es así. Tu trabajas 1760 horas al año, y eso son 39,5 horas semanales, teniendo en cuenta los domingos y festivos. No sería necesaria ninguna corrección si trabajaras igual de lunes a sábado. En las farmacias (y mayoría de comercios), se suele dejar que el horario se compense sólo. Es decir, que si la fiesta cae de lunes a viernes, en teoriá descansas más de lo que te toca, y si cae en sabado descansas menos. Como las fiestas caen en todos los días de la semana se acaban compensando unas horas con otras.
El problema es cuando trabajas en una farmacia de horario ampliado, entonces sí puede ser interesante ajustar las horas. Si un año ves que caen muchas fiestas en jueves, se lo puedes comentar a tu jefe para que te compense esos descansos. En ese sentido el jueves es un día que se presta a eso porque hay varios días señalados que son jueves (Jueves santo, corpus christi, ascensión) más las posibles fiestas locales (en mi pueblo es fiesta el segundo día de la cuaresma, que es jueves)