Hola Arabela,
desde mi punto de vista y por lo que yo sé lo que te ha dicho el de atención primaria no es correcto y te diré porqué. Fibraguar lo que hace es retrasar la absorción de los glúcidos, que no inhibir la lipasa gástrica y pancreática reduciendo las grasas de los alimentos (orlistat). Las lipasas lo que hacen es hidrolizar los lípidos por lo que no se absorben (aproximadamente el 30%). Almacenamos mayoritariamente lípidos.
Como sabrás, las vitaminas liposolubles se disuelven en grasas y aceites por lo que al actuar el orlistat como antes te he comentado, puede afectar a la absorción de las mismas y por ello requieren un complejo vitamínico (durante unos 20 días recomiendo yo al mes porque las vitaminas liposolubles se acumulan en hígado y tejido graso y pueden ser tóxicas en exceso, aunque por un complejo vitamínico normal tampoco va a pasar nada).
Como bien sabrás los lípidos (grasa) y los glúcidos (hidratos de carbono) no son lo mismo, por lo que cada fármaco actúa de una manera.
Por cierto, si el endocrino no te recomendó complejo alguno y es el especialista..no entiendo porque el de atención primaria se niega a prescribirtelo (probablemente por su desinformación. Más bien este fármaco lo que puede provocarte son hipoglucemias, que es delicado, mas que problemas de absorción de vitaminas). De todas formas te lo venderán sin receta. No es recomendable que te acostumbres a tomar ni goma guar ni ningún otro fármaco para perder peso e ir al baño. Todos los fármacos tienen una "vida media" (y no lo digo en el sentido farmacocinético).
Espero haberte ayudado.
Un saludo.